Desde los orígenes de Sant Joan les Fonts, el territorio era una zona de paso que unía, en una misma ruta, la costa con las tierras del interior. En época medieval el camino entre condados, como el de Besalú, el de Cerdanya o el de Berga, se dibujaba por el territorio santjuanense utilizando la única vía de comunicación del momento, el puente sobre el Fluvià.

La primera referencia es del siglo XIII, no obstante el actual es el resultado de la reconstrucción hecha después de los terremotos del siglo XV que afectaron toda la comarca. Gran parte del puente está construido con piedra volcánica, un material muy usado en la comarca, y consta de un arco central grande y con forma apuntada y dos arcos pequeños en los laterales.