La iglesia fue construida en el siglo XVI, con posterioridad a los edificios anteriormente citados. Es de una sola nave sin crucero con capillas laterales situadas entre los contrafuertes. Destaca la portalada decorada por esculturas de gran calidad, que fueron decapitadas en el siglo XIX.En el interior de la iglesia, delante del presbiterio, encontramos las lápidas sepulcrales de Baltasar Sorió, lector de la Catedral, y Juan Izquierdo, obispo de Tortosa de 1574 a 1585, principales impulsores de la fundación y construcción de los Reales Colegios. También encontramos otros elementos que no formaban parte del conjunto original, procedentes de la desaparecida Casa de la Ciudad. Presidiendo la nave central encontramos el armario del antiguo archivo de Tortosa.

Encastada en el muro interior de la actual salida hacia la Plaza Mossèn Sol encontramos la portalada del estudio del antiguo ayuntamiento, correspondiente al edificio construido en el siglo XVI en la calle Ciutat, que fue derribado en 1915.